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Bioinformática 6 de Noviembre. Amplicones

Las herramientas y programas listados a continuación serán utilizadas para resolver los ejercicios: pandaseq fastqc fastx_trimmer qiime: assign_taxonomy.py, make_otu_table.py, biom convert R phyloseq: plot_bar, plot_ordination Documentación: http://qiime.org/scripts/index.html https://joey711.github.io/phyloseq/tutorials-index.html Ejercicios. Descarga los archivos que utilizaremos para esta sesión: https://drive.google.com/drive/folders/0B4yYJADlEqTnQW9kckpvbGlrYms?usp=sharing 1. Utilizando

Publicado en: 2017 Bioinformática, curso_bioinfo_2017

Bioinformática ejercicio 18 de septiembre

1. Lee el siguiente primer: http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer Explica: ¿Qué es la cobertura de secuenciación? ¿Qué utilidad tiene la ecuación Lander-Waterman? ¿Porqué se originan errores de ensamblado en regiones repetitivas? ¿Qué es un contig? ¿Qué es un scaffold? ¿Qué diferencia hay entre

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Bioinformática. Ejercicio 28 Agosto

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Ejercicio BLAST agosto 2017

Formulario respuestas Loading… Resumen del manual de blast https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279675/

Publicado en: curso_bioinfo_2017

Bioinformática. Tarea 2

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Bioinformática. Tarea 1.

Estimad@s alumnos: Completen el siguiente tutorial de Linux para que practiquen lo visto en clase. http://ryanstutorials.net/linuxtutorial/ Por favor vayan adelantando la lectura de BLAST. Pueden descargar de la siguiente liga: https://drive.google.com/file/d/0B4yYJADlEqTnbS01OUNpMTFJWDQ/view?usp=sharing En la parte inferior encontrarán el formulario en donde

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