Dra. Mariana Benítez Keinrad

     
 
Laboratorio Nacional de Ciencias de la Sostenibilidad (Lancis)
Investigador Titular "A"
Teléfono: 5623-7712
E-Mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. (mbenitez en iecologia.unam.mx)
   
     

  Investigación

Líneas de investigación:

- Ecología evolutiva del desarrollo
- Agroecología
- Modelado matemático de sistemas biológicos

  Formación Académica


Estancia posdoctoral. Laboratorio de Fisiología Molecular de las Plantas. CEITEC - Universidad Masaryk, Brno, República Checa (julio 2011- agosto 2012).

Estancia posdoctoral. Centro de Ciencias de la Complejidad, C3. Universidad Nacional Autónoma de México (mayo 2010-abril 2011).

Doctorado en Ciencias Biomédicas. Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México (2005-2010). Obtención del grado con la tesis “Redes de regulación genética y patrones morfogenéticos en plantas”, bajo la dirección de la Dra. Elena Álvarez-Buylla Roces.

Maestría en Dinámica no Lineal y Sistemas Complejos. Universidad Autónoma de la Ciudad de México (2004-2006). Obtención del grado con la tesis “Redes de regulación genética y determinación de tipo celular en Arabidospsis thaliana”, dirigida por la Dra. Elena Álvarez-Buylla Roces.

Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México (2000-2004). Semestre de intercambio en Bishop's University, Quebec, Canadá (2001). Obtención del grado con la tesis “Criticalidad autoorganizada en sistemas ecológicos”, dirigida por el Dr. Pedro Miramontes Vidal.
Trayectorias ontogenéticas en la defensa de las plantas


  Publicaciones

Artículos

Mora Van Cauwelaert, E., Del Angel, A., Antonio, J., Benítez, M., Azpeitia, E. M. (2015). Development of cell differentiation in the transition to multicellularity: a dynamical modeling approach. Frontiers in Microbiology, 6, 559.

Escalante AE, Rebolleda-Gómez M, Benítez M, Travisano M. Ecological perspectives on synthetic biology: insights from microbial population biology. Front Microbiol. 2015 Feb 26;6:143. doi: 10.3389/fmicb.2015.00143.

Hernández-Hernández V, Rueda D, Caballero L, Alvarez-Buylla ER, Benítez M. Mechanical forces as information: an integrated approach to plant and animal development. Front Plant Sci. 2014 Jun 10;5:265. doi: 10.3389/fpls.2014.00265.

Benítez M, Hejátko J. Dynamics of cell-fate determination and patterning in the vascular bundles of Arabidopsis thaliana. PLoS One. 2013 May 27;8(5):e63108. doi: 10.1371/journal.pone.0063108.

Azpeitia E, Weinstein N, Benítez M, Mendoza L, Alvarez-Buylla ER. Finding Missing Interactions of the Arabidopsis thaliana Root Stem Cell Niche Gene Regulatory Network. Front Plant Sci. 2013 Apr 30;4:110. doi:10.3389/fpls.2013.00110.

Žd'árská M, Zatloukalová P, Benítez M, Šedo O, Pot?šil D, Novák O, Sva?inová J, Pešek B, Malbeck J, Vaší?ková J, Zdráhal Z, Hejátko J. Proteome analysis in Arabidopsis reveals shoot- and root-specific targets of cytokinin action and differential regulation of hormonal homeostasis. Plant Physiol. 2013 Feb;161(2):918-30. doi: 10.1104/pp.112.202853.

Benítez M. An interdisciplinary view on dynamic models for plant genetics and morphogenesis: scope, examples and emerging research avenues. Front Plant Sci. 2013 Jan 31;4:7. doi:10.3389/fpls.2013.00007.
Benítez M, Azpeitia E, Alvarez-Buylla ER. Dynamic models of epidermal patterning as an approach to plant eco-evo-devo. Current Opinion in Plant Biology 2013 Feb;16(1):11-8 (doi:http://dx.doi.org/10.1016/j.pbi.2012.11.005).

Hernández Hernández V, Niklas JK, Newman SA, Benítez M*. Dynamical patterning modules in plant development and evolution. International Journal of Developmental Biology 2012 56: 661 - 674 (doi:10.1387/ijdb.120027mb).

Caballero L, Benítez M, Alvarez-Buylla ER, Hernández S, Arzola VA, Cocho G. An epigenetic model for pigment patterning based on mechanical and cellular interactions. JEZ Part B: Molecular and Developmental Evolution 2012, 318(3):209-23 (DOI:10.1002/jez.b.22007).

Arellano G, Argil J, Azpeitia E, Benítez M, Carrillo M, Góngora P, Rosenblueth DA, Alvarez-Buylla ER. "Antelope": a hybrid-logic model checker for branching-time Boolean GRN analysis. BMC Bioinformatics 2011, 12(1):490 (DOI: 10.1186/1471-2105-12-490).

Azpeitia E, Benítez M, Padilla-Longoria P, Espinosa-Soto C, Alvarez-Buylla ER. Dynamic network-based epistasis analysis: boolean examples. Front Plant Sci. 2011 Dec 15;2:92. doi: 10.3389/fpls.2011.00092.

Alvarez-Buylla ER, Benítez M, Espinosa-Soto C. Mutually reinforcing patterning mechanisms. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2011, 6;12(8):533. (DOI: 10.1038/nrm3079-c1). Author's reply.

Benítez M, Monk N, Alvarez-Buylla ER. Epidermal patterning in Arabidopsis: models make a difference. JEZ Part B: Molecular and Developmental Evolution 2011, 316(4):241-53. (DOI: 10.1002/jez.b.21398).

Azpeitia E, Benítez M, Vega I, Villarreal C, Alvarez-Buylla ER. Single-cell and coupled GRN models of cell patterning in the Arabidopsis thaliana root stem-cell niche. BMC Systems Biology 2010, 4:134. (DOI: 10.1186/1752-0509-4-134 ).

Alvarez-Buylla ER, Azpeitia E, Barrio R, Benítez M, Padilla-Longoria P. From ABC genes to regulatory networks, epigenetic landscapes and flower morphogenesis: making biological sense of theoretical approaches. Seminars in Cell and Developmental Biology 2010, 21:108-17. (DOI: 10.1016/j.semcdb.2009.11.010).

Benítez, M. and Alvarez-Buylla ER. Dyamic-module redundancy confers robustness to the gene regulatory network involved in hair patterning of Arabidopsis epidermis. Biosystems 2010, 102:11-1. (DOI: 10.1016/j.biosystems.2010.07.007).

E. R. Alvarez-Buylla, M. Benítez, A. Chaos, Y. Cortes-Poza, C. Espinosa-Soto, R.B. Lotto, D. Malkin, G.J. Escalera-Santos, P. Padilla Longoria. Floral Morphogenesis: Stochastic Explorations of a Gene Network Epigenetic Landscape. PloS ONE 2010, 3:e3626. (DOI: 10.1371/journal.pone.0003626).

M. Benítez, C. Espinosa-Soto, P. Padilla-Longoria, E. R. Alvarez-Buylla. Interlinked nonlinear subnetworks underlie the formation of robust cellular patterns in Arabidopsis epidermis: a dynamic spatial model. BMC Systems Biology 2008, 2:98 (DOI: 10.1186/1752-0509-2-98 ).

M. Benítez, C. Espinosa-Soto, P. Padilla-Longoria, J. Díaz and E. R. Alvarez-Buylla. Equivalent genetic regulatory networks in different contexts recover contrasting spatial cell patterns that resemble those in Arabidopsis root and leaf epidermis: a dynamic model. International Journal of Developmental Biology 2007, 51: 139-155 (DOI: 10.1387/ijdb.062183mb).

Alvarez-Buylla, E. R., Benítez, M., Espinosa-Soto, C. Phenotypic evolution is restrained by complex developmental processes. HFSP Journal 2007, 1: 99-103. (DOI: 10.2976/1.2749445).

Alvarez-Buylla ER, M. Benítez, E. Balleza Dávila, Á. Chaos, C. Espinosa-Soto and P. Padilla-Longoria. Gene regulatory network models for plant development. Current Opinion in Plant Biology, 2007 10: 83–91 (DOI: 10.1016/j.pbi.2006.11.008).


Capítulos de libro y libros

En imprenta - Juan A. Arias, E Azpeitia, M Benítez, Ana E. Escalante, V Hernández-Hernández, E Mora van Cauwelaert. “Physicochemical factors in the organization of multicellular aggregates and plants”. En The Origin and Consequences of Multicellularity, K. Niklas, SA Newman (Eds), The Vienna Seeries on Theoretical Biology, MIT Press.

En imprenta – Jardón-Barbolla L, Benítez M. “La comunidad agroecológica como unidad ecológica, de domesticación y de conservación”. En XV Aniversario del Programa Ciencia y Sociedad. Guerrero MacManus F, Valadez Blanco O, Vizcaya Xilotl O (Editores). Editado por la Facultad de Ciencias y el CEIICH, UNAM.

Benítez M, Fornoni J, García-Barrios L, López Martínez R. “Networks in agroecology”. En Frontiers in Ecology, Evolution and Complexity. Editorial Copit – Arxives, 2014. ISBN: 9781938128059.

Alvarez-Buylla ER, Benítez M, Piñeyro-Nelson A. “Conclusiones”. En El maíz en peligro ante los transgénicos: un análisis integral del caso México. Alvarez-Buylla ER, Piñeyro-Nelson A (Coordinadoras). Editado por la UCCS y el CEIICH, 2014.

Benítez M “El organismo en su ambiente”, en E. Vizcaya, L. Pacheco y O. Miramontes, 2013. Ciencia y Sociedad: pinceladas. CopIt ArXives, Mexico. SC0004ES. ISBN: 978-1- 938128-04-2.

Benítez M, Miramontes O, Valiente-Banuet A (Editors). Frontiers in Ecology, Evolution and Complexity. Prólogo de Stuart Kauffman. Editorial Copit – Arxives 2014. ISBN: 9781938128059.
URL:http://scifunam.fisica.unam.mx/mir/copit/TS0012EN/TS0012EN.html

Benítez M, Milán Fe L., Ortiz Medrano A. Ciencias 1: Biología. Ed. Santillana Nuevo México, 2012, México. Libro aprobado por la SEP como libro de texto. ISBN 978-607-712-023-0.

Caballero L, Benítez M, Coronado G. Emergencia de formas biológicas en la complejidad biocultural: Epigenética y Obesidad. Por aparecer en el libro "Viaje a la Complejidad", Nicolás Caparrós (ed.) 2011, Biblioteca Nueva, Madrid. ISBN 978-84-9940-466-0.

Alvarez-Buylla ER, Benítez M. Complejidad genética, morfogénesis y transgénicos: las plantas como caso de estudio. En “Encuentros con la Complejidad”, Flores Valdés J, Martínez-Mekler G (comp.). Siglo XXI Editores, 2011, México. ISBN: 978-607-03-0278-7.

Alvarez-Buylla ER, Benítez M, Corvera-Poiré A, Chaos Cardor A, de Folter S, Gamboa A, Garay-Arroyo A, García Ponce B, Jaimes-Miranda F, Pérez-Ruiz RV, Piñeyro-Nelson A, Sánchez- Corrales YE. Flower Development. The Arabidopsis Book. Rockville, MD: American Society of Plant Biologists, 2010. (doi:10.1199/tab.0127).

Benítez M. Desarrollo: La Odisea del Organismo. Copit-Arxives, México. TS0009ES. ISBN: 978-1-938128-00-4.

Alvarez-Buylla ER, M. Benítez, M. Aldana, A. Chaos, G. Escalera Santos, R. Verduzco-Vázquez, P. Padilla-Longoria. Gene Regulatory Models for Plant Development, en “Plant Developmental Biology-Biotechnological Perspectives: Volume 1.” E.C. Pua y M. Davey (eds), 2008, Springer, Germany. ISBN 978-3-642-02301-9.

Alvarez-Buylla, ER, Balleza, M. Benítez, C. Espinosa-Soto y P. Padilla-Longoria. Gene regulatory network models: a dynamic and integrative approach to development; en “Practical Systems Biology”, A. Hetherington y C. Grierson (eds), Taylor and Francis, 2008, England. ISBN 041540780x

Alvarez-Buylla, ER; Benítez, M; Chaos, A; Cortéz-Poza, Y; Esponosa-Soto, C; Padilla- Longoria, P. De genes a patrones: una propuesta metodológica, en “La Física Biológica en México: Temas Selectos”. García-Colín, Scherer, L.; Dagdug, L.; Miramontes, P.; Roja, Arturo (Coord). El Colegio Nacional, 2006. México. pp. 473-486.

   Tesis

Tesis terminadas

- Valeria Hernández Hernández. 2015. Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM.

- Carlos F. Buenabad Najar. 2015. Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UNAM.

- Juan Arias del Angel. 2014. Licenciatura en Ciencias Genómicas UNAM.

- Valeria Hernández Hernández. 2011. Proyecto de Servicio Social (trabajo recepcional) para la Licenciatura en Biología en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco.

- Rafael Verduzco Vázquez. 2009. Licenciatura en Ciencias, Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de Morelos (Co-dirección con José Díaz).

Tesis en curso

- Rafael López Martínez. “Modelado y evalución de la resistencia del sistema agroecológico milpa”. Posgrado en Ciencias Biológicas UNAM (en revisión para obtención del grado).

- Cecilia González González. "Efecto del manejo agrícola en la conservación a nivel paisajístico" (por presentar examen de grado en noviembre del 2015). Licenciatura en Biología UNAM.

- Andrea Lizbeth Domínguez Román. Mecanismos de generación de la plasticidad fenotípica en las plantas: la heterofilia como un sistema de estudio. Posgrado en Ciencias Biológicas UNAM.

- Cristina Alonso. “Cultura y Evolución: diversidad morfológica asociada al uso de variedades locales de chile en dos regiones del Estado de Oaxaca” (codirectora con Lev Jardón). Posgrado en Geografía UNAM.

- César I. Ojeda Linares. “Evaluación de la variabilidad morfológica de las hojas de Arabidopsis thaliana como indicador de la plasticidad fenotípica de distintos ecotipos.” Posgrado en Ciencias Biológicas UNAM.

- Juan Antonio Arias del Angel. “Un modelo dinamico booleano para la determinacion de tipos celulares durante el proceso de desarrollo de Myxococcus xanthus, organismo modelo para el estudio de la ulticelularidad” Doctorado en Ciencias Biomédicas UNAM.

- Benito Francisco Vazquez Quesada. “Redes de interacción planta-herbivoro en cultivos de maíz (Zea mays) con diferente grado de simplificación”. (Miembro del comité tutoral; tutor principal: Juan Fornoni, IE UNAM). Maestría en Ciencias Biológicas UNAM.

  Becas y Distinciones académicas


Miembro del Sistema Nacional de Investigadores – Nivel 1 (ingreso en 2014)

Programa de Primas al Desempeño del Personal Académico de Tiempo Completo (PRIDE) – Nivel B (ingreso en 2014)

GENESYS young scientist travel award. Otorgado por la organización GENESYS en el marco del International Conference on Systems Biology, Edimburgo, 2010.

Mención Honorífica en el Posgrado de Ciencias Biomédicas de la Universidad Nacional Autónoma de México, 2010.

Mención Honorífica en el Programa de Maestría en Dinámica no Lineal y Sistemas Complejos, de la Universidad Autónoma de la Ciudad de México, 2007.

Miembro del Consejo Directivo del C3, Centro de Ciencias de la Complejidad, desde el 3 mayo 2013