Dr. Juan Pablo Jaramillo Correa

     
 
Laboratorio: Genética y Ecología
Investigador Titular "A"
Departamento de Ecología Evolutiva
Teléfono: 5622-9015
E-Mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. (jaramillo en ecologia.unam.mx)
web page:
   
     

  Investigación

PRINCIPALES LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN:

  • Genética de poblaciones y filogeografía de árboles forestales
  • Genómica Ecológica de plantas
  • Genética de la conservación
  • Evolución del genoma mitocondrial de plantas

DESCRIPCIÓN:
En particular buscamos genes involucrados en las respuestas adaptativas de las plantas a su ambiente utilizando útiles moleculares avanzados (SNPs, SSRs, cpSSRs, etc.). Al correlacionar la variación de estos marcadores con parámetros cuantitativos, históricos, demográficos y medioambientales, se puede obtener una idea de cuales genes están implicados en la adaptación. Por otro lado, al entender como están distribuidos dichos genes en el espacio y como han variado en el tiempo, se pueden mejorar los programas de conservación de las especies de interés creando verdaderas unidades de conservación con significado evolutivo.

PALABRAS CLAVE:
Adaptación, Genómica, Filogeografía, Conservación, ADN mitocondrial

PRINCIPALES COLABORADORES:

  • En la UNAM: Luis Eguiarte, Ella Vázquez, Juan Núnez, Daniel Piñero, María del Carmen Madujano, Blanca Hernández-Baños, Alfonso Valiente
  • En México: Victoria Sosa (Inst. Ecol. Xalapa), Christian Wehenkel (Universidad Juárez del Edo. de Durango), Cuahutemoc Saenz Romero (IIAF-Univ. Michoacana San Nicolás de Hidalgo)
  • En el extranjero: Jean Bousquet, Damase P. Khasa (Univ. Laval, Canadá); Jean Beaulieu (CFS-NRCAN, Canadá); Santiago C. González-Martínez, Delphine Grivet, Myriam Heuertz (CIFOR-INIA, España); Alejandra Vázquez-Lobo (UC-Davis, EEUU); Beppe Vendramin (Istituto di Genetica Vegetale-CNR, Italia)

    Formación Académica


- Pregrado (licenciatura) en biología, Universidad de Los Andes, Bogotá, Colombia. 1993-1998
(Tesis: Estudio poblacional de los genes APOE, APOB (3’VNTR) y ACE en comunidades negras e indígenas de Colombia)

- Maestría en ciencias forestales, Université Laval, Québec, Canadá. 1999-2000
(Tesis: Diferencia en las fuerzas evolutivas que actúan sobre los caracteres cuantitativos, las allozimas y los marcadores ESTP en poblaciones de abeto blanco (Picea glauca) de Québec)

- Doctorado en ciencias forestales, Université Laval, Québec, Canadá. 2001-2004
(Tesis: Diversidad genética mitocondrial de Picea mariana: un análisis filogeográfico de su área de distribución y de la zona de contacto con P. rubens)

- Postdoctorado, Université Laval - UNAM. 2005-2008
(Proyecto de investigación: Filogeografía y evolución de los Abies mexicanos)

- Postdoctorado, CIFOR-INIA, Ministerio de Ciencia e Innovación Español, Madrid, España. 2008-2009 (Proyecto de investigación: Genómica ecológica de Pinus pinsater)


  Publicaciones

ARTÍCULOS CIENTÍFICOS

Total: 20, Número de citas en enero de 2013: 405, Índice h: 11

Jaramillo-Correa JP, Aguirre-Planter E, Eguiarte LE, Khasa DP, Bousquet J. Evolution of an ancient microsatellite hotspot in the conifer mitochondrial genome and comparison with other plants. Journal of Molecular Evolution (2013). En prensa.

Pavy N, Gagnon F, Rigault P, Blais S, Deschênes A, Boyle B, Pelgas B, Deslauriers M, Clément S, Lavigne P, Lamothe M, Cooke JEK, Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Isabel N, MacKay J, Bousquet J. Development of high-density SNP genotyping arrays 1 for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeneric taxa. Molecular Ecology Resources (2013). En prensa.

Aguirre-Planter E, Jaramillo-Correa JP, Gómez-Acevedo S, Khasa DP, Bousquet J, Eguiarte LE. Phylogeny, diversification rates and species boundaries of Mesoamerican firs (Abies, Pinaceae) in a genus-wide context. Molecular Phylogenetics and Evolutin (2012) 62, 263-274.

Chancerel E, Lepoittevin C, Jaramillo-Correa JP, Eckert A, Wegrzyn J, Zelenika D, Boland A, Le Provost G, Frigerio JM, Garnier-Géré P, Boury C, Grivet D, Gonzalez-Martinez SC, Neale D, Cervera MT, Plomion C. Development and implementation of a highly-multiplexed SNP array for genetic mapping in maritime pine. BMC-Genomics. (2011) 12:368 (doi:10.1186/1471-2164-12-368).

Jaramillo-Correa JP, Grivet D, Terrab A, Kurt Y, De-Lucas AI, Wahid N, Vendramin GG, Gonzalez-Martinez SC. The Strait of Gibraltar as a major biogeographic barrier in Mediterranean conifers: a comparative phylogeographic survey. Molecular Ecology (2010) 19, 5453-5468.

Gerardi S, Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Bousquet J. Coordinated and uncoordinated patterns of cpDNA and mtDNA geographical diversity in transcontinental black spruce: more refuges and new Holocene genome assemblages. Molecular Ecology (2010) 19, 5265-5280.

Jaramillo-Correa JP, Verdu M, Gonzalez-Martinez SC. The contribution of recombination to heterozygosity differs among plant evolutionary lineages and life-forms. BMC-Evolutionary Biology. (2010) 10:22 (doi:10.1186/1471-2148-10-22).

Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Khasa PD, Bousquet J. Inferring the past from the present phylogeographic structure of North American Forest trees: seeing the forest for the genes. Canadian Journal of Forest Research (2009) 39, 286-307. (Artículo de revisión invitado).

Jaramillo-Correa JP, Aguirre-Planter A, Khasa DP, Eguiarte LE, Piñero D, Furnier GR Bousquet J. Ancestry and divergence of subtropical montane forest isolates: molecular biogeography of the genus Abies (Pinaceae) in southern Mexico and Guatemala. Molecular Ecology. (2008) 17, 2476-2490.

Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Ledig FT, Bousquet J. Decoupled mitochondrial and chloroplast DNA population structure reveals Holocene collapse and populations isolation in a threatened Mexican-endemic conifer. Molecular Ecology. (2006) 15, 2787-2800.

Khasa PD, Jaramillo-Correa JP, Jaquish B Bousquet J. Contrasting microsatellite variation between subalpine and western larch, two closely related species with contrasting distribution patterns. Molecular Ecology. (2006) 15, 3907-3918.

Jaramillo-Correa JP Bousquet J. Mitochondrial genome recombination in the zone of contact between two hybridizing conifers. Genetics (2005) 171, 1951-1962.

Godbout J, Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J Bousquet J. A mitochondrial DNA minisatellite reveals the postglacial history of jack pine (Pinus banksiana Lamb.), a transcontinental North American conifer. Molecular Ecology. (2005) 14, 3497-3512.

Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Bousquet J. Variation in mtDNA reveals multiple distant glacial refugia in black spruce (Picea mariana), a transcontinental North American conifer. Molecular Ecology (2004) 13, 2735-2747.

Jaramillo-Correa JP, Bousquet J. New evidence from mitochondrial DNA of a progenitor-derivative species relationship between black spruce and red spruce (Pinaceae). American Journal of Botany, (2003) 90, 1801-1806.

Jaramillo-Correa JP, Bousquet J, Beaulieu J, Isabel N, Perron M, Bouillé M. Cross-species amplification of mitochondrial DNA sequence-tagged-site markers in conifers: the nature of polymorphism and variation within and among species in Picea. Theoretical and Applied Genetics, (2003) 106, 1353-1367.

Gamache I, Jaramillo-Correa JP, Payette S, Bousquet J. Diverging patterns of mitochondrial and nuclear DNA diversity in subarctic black spruce: imprint of a founder effect associated with postglacial colonization. Molecular Ecology, (2003) 12, 891-901.

Alvarez D, Ruiz-Garcia M, Guerrero J, Jaramillo-Correa JP. Detection of stabilizing selection in favour of the Santa Cruz homokaryotype in Drosophila pseudoobscura populations from the high plateau of the Colombian Andes. Genetics and Molecular Research, (2002) 1, 1-24.

Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Bousquet J. Contrasting evolutionary forces driving population structure at allozymes, expressed sequence tag polymorphisms and quantitative traits in white spruce. Molecular Ecology, (2001) 10, 2729-2740.

Jaramillo-Correa JP, Keyeux G, Ruiz-Garcia M, Rodas C, Bernal J. Population genetic analysis of the genes APOE, APOB(3’VNTR) and ACE in some Black and Amerindian communities from Colombia. Human Heredity, (2001) 52, 14-33.

CAPÍTULOS EN LIBROS Y ARTÍCULOS DE DIVULGACIÓN

González-Martínez SC, Dillon S, Garnier-Geré P, Krutovsky K, Alía R, Burgarella C, García-Gil MR, Grivet D, Heuertz M, Jaramillo-Correa JP, Lascoux M, Savolainen O, Tsumura Y, Vendramin GG. Landscape of nucleotide diversity and association mapping. En: Kole C, Plomion C, Bousquet J. 2011. Genetics, Genomics and Breeding of Conifers. 239-265. CRC Press. Reino Unido.

Boege, K., A. Córdoba, C.A. Domínguez, H. Drummond, L.E. Eguiarte, J. Fornoni, L.I. Falcón, G. García, J.P. Jaramillo, J. Núñez, D. Piñero, V. souza, R. Torres. 2011. La ecología evolutiva: interfase de la ecología y la evolución. Ciencias (Revista de Divulgación de la Ciencia de la UNAM). 103, 28-37

Beaulieu J, Godbout J, Jaramillo-Correa JP, Bousquet J. Sur la trace du passé de nos conifères. Santé Biodiversité des Forêts – Nouvelles (2006) 10 (1:), 2 y 6.

 

     Tesis


FINALIZADAS:
Julie Godbout (Maestría, co-director)
« Histoire postglaciaire du pin gris (Pinus banksiana) retracée à partir de son ADN mitochondrial » Université Laval, Québec, Canadá. 2006

Sébastien Gerardi (Maestría, co-director)
« Étude phylogéographique comparée des polymorphismes des génomes chloroplastique et mitochondrial de l’épinette noire » Faculté de Foresterie de Géomatique, Université Laval, Québec, Canadá. 2009

Juan José Ramírez Lerma (Licenciatura, director)
« Caracterización de genes de la subfamilia 4 de factores de transcripción R2R3-MYB en el abeto Abies Religiosa » UNAM, México, DF. 2012

EN PROCESO:
Julia Múgica (Licenciatura, director)
« Patrones de diversidad y detección de grupos genéticos en dos especies de Abies con distribuciones contrastantes en la Faja Volcánica Transmexicana » UNAM, México, DF.

Ivan Méndez (Licenciatura, director)
« Efectos paisajísticos en la distribución de la diversidad genética en una población de Abies religiosa » UNAM, México, DF.

Jerónimo Hernández Piña
« Origen e identidad filogenética de Acer Saccharum subsp. skutchii: un arce endémico de México » UNAM, México, DF.

Zulema Quiñonez (Doctorado, co-director)
« Mapeo de la diversidad genética de Picea chíhuahuana Martínez » Universidad Juárez del Estado de Durango.

 

  Becas y Distinciones académicas

PRIDE / SNI

Sistema Nacional de investigadores - Nivel II. A partir de enero de 2012

DGAPA-PRIDE - Nivel B. A partir de abril de 2011

DGAPA-PAIPA - Nivel B. Octubre 2009 a abril 2011

DGAPA-PEII - Nivel B. Octubre 2009 a abril 2011

Beca Juan de la Cierva - Ministerio de Educación Español. 2008-2009

Beca de investigación (Fond de soutiens au doctorat) - Faculté de Foresterie et Géomatique, Université Laval. 2001-2004

Beca de excelencia - Ministère de l’Éducation du Québec. 1999-2003

 

     

Tags: Botánica, Genómica, Filogeografía